| 0 |
|
Как стало известно, Ливерморская национальная лаборатория развернула новый высокопроизводительный вычислительный кластер на базе процессоров AMD.
Проект, получивший название Mammoth, нацелен на решение задач, связанных с исследованиями COVID-19.
Решение состоит из 64 серверов, каждый из которых оснащен двумя процессорами AMD Epyc. Система имеет в общей сложности 8192 процессорных ядра, и способна достигать, по заявлению разработчиков пиковой мощности 294 терафлопс.
Также отмечается, что в отличие от большинства высокопроизводительных вычислительных кластеров в Mammoth упор делается на память, а не на чистую вычислительную мощность. Помимо двух процессоров Epyc, каждый из 64 серверов оснащен 2 ТБ высокоскоростной памяти DRAM и почти 4 ТБ энергонезависимой памяти.
В рамках проводимых исследований COVID-19 ученые из Lawrence Livermore проводят моделирование вирусов и другие сложные задачи, которые требуют работы с огромными массивами данных. Эти массивы в некоторых случаях настолько велики, что не помещаются в памяти стандартного сервера, поэтому их приходится разделять между несколькими машинами, что замедляет обработку. В серверах Mammoth с оптимизированной памятью это ограничение устранено.
«Среди прочего мы вычисляем свободную энергию связывания [белков] с помощью Rosetta Flex, кода, который был ограничен памятью на других машинах на 12 или 16 одновременных вычислений на узел», - пояснил Томас Десотелс, ученый из Ливерморской национальной лаборатории. «Mammoth позволяет нам выполнять 128 вычислений Rosetta Flex одновременно на одном узле, поднимая эффективность нашей работы почти в восемь раз».
Сообщается, что Mammoth помог сократить продолжительность некоторых видов геномного анализа с нескольких дней до нескольких часов. Более того, ученые Lawrence Livermore теперь не должны тратить уйму времени на разбиение массивов данных на более мелкие части, чтобы преодолеть ограничения в вычислениях.
Ready, set, buy! Посібник для початківців - як придбати Copilot для Microsoft 365
| 0 |
|
